貯液器：清潔是保持流動相貯液器正常使用的關鍵，要盡可能使用HPLC級的溶劑和試劑含有緩沖鹽和非HPLC級的流動相一定要通過0.5μm的過濾器以除去其中的微粒物質。改變流動相時應防止交叉污染，陳舊的流動相和用久了的試劑瓶應定期廢棄，防止生長微生物和組分改變。貯器內壁定期清洗，里面的附件要經常更換。

　　泵：泵的密封圈是易磨損的部件，密封墊圈的損壞可引起系統的許多故障。有人建議3個月換一次墊圈。但也不能一概而論，要看墊圈的材料質量，使用壓力大小、保養以及緩沖液的情況而定。采取下列措施可以延長墊圈的壽命：

　　1 每天要把泵中的緩沖液體洗干凈，防止鹽沉積，泵要浸在無緩沖液的溶液或有機溶劑中；

　　2 用HPLC級試劑；

　　3 用燒結不銹鋼沉子。要注意防止因泵阻塞造成壓力過高而損壞柱塞桿或燒壞電機。

　　進樣器：停機后要用溶劑沖洗干凈進樣器內殘留的樣品和緩沖鹽，防止無機鹽沉積和樣品微粒造成閥轉子面磨損或阻塞，嚴禁用氣相色譜那樣的尖針頭進樣。

　　色譜柱：防止柱性能下降有以下幾方面的措施：

　　1 溶劑的化學腐蝕不能太強；

　　2 避免微粒在柱頭沉降；

　　3 泵上要裝壓力限制器，防止壓力過高沖擊大；

　　4 流動相PH》7時用大粒度同種填料作預柱；

    5 柱頭加燒結片不銹鋼濾片，需要時加保護柱；

　　檢測器：要保持檢測器清潔，每天用后連同色譜柱柱一起沖洗。提倡不定期用強溶劑反向沖洗檢測池（拆開柱）。用脫過氣的流動相，防止空氣泡卡在池內。檢測器燈有一定的壽命，不用時不要打開燈。

　　操作極限：每臺泵都有壓力上限，系統達到預定值時會自動停泵，這樣能保護柱和其他硬件。上限壓力設在20MPa以下，泵墊圈和進樣閥耐用，但壓力上限設定過低會延長分析時間。根據檢驗設定壓力上限在15～20MPa為宜。新柱的壓力比較低，隨著使用時間加長而壓力上升，所以設定的壓力上限也應變化。在梯度洗脫中應考慮因流動相的變化而引起的壓力變化，避免上限壓力過低造成中途停泵。帶有微機的系統還需設定壓力下限，一般在0.5～1MPa，在貯器中流動相被抽干或嚴重滲漏時會自動停泵。有時下限壓力設在0也會自動停泵。